Dizi Kapsama Nasıl Hesaplanır

Zenginleştirme çalışmaları kapsamıdüzeyini belirlemek için sıralama verilerinhesaplanmasını gerektirir . Bu entegre DNA numune hazırlığı ve ön zenginleştirme havuzu gerektiren gen sıralama laboratuvarları ile öncelikle yapılır . Sıralama kapsama hesaplanmasıortalama sıralama kapsama ,toplam hedeflenen üsleri vezenginleştirme verimlilik, değişkenleri kullanarak gerektirir . Bu hesaplamayı gerçekleştiren bir denklemin içine tüm bu değişkenler girerek yapılır . Talimatlar
1

ortalama sıralama kapsama alanı hesaplamak için kullanılandenklemi yaz. Bu normalleştirilmiş ortalama kapsama bölüistenilen kapsama gibi görünecektir . İstenilen kapsama 10x ve​​ortalama normalize kapsama 0.2 ise,ortalama sıralama kapsama 50.
2

dizilememiktarını hesaplamak için kullanılandenklemi yaz. Bu (toplam hedeflenen bazlar ) gibi ( dizileme kapsama ortalama ) /( zenginleştirme verimlilik) = dizilim miktarı .
3

» toplam hedeflenen üsleri » için 62 MB Tak ve 0,65 bakacağız » zenginleştirme verimlilik. » 50xsıralama teminat miktarını ekleyin vedenklem (62) (50) /0.65 gibi görünecektir . Denkleminsonucu 4.8 GB dizileme veri olacaktır .

You May Also Like

About the Author: elgame

Αφήστε μια απάντηση